Please use this identifier to cite or link to this item: https://ir.sc.mahidol.ac.th/handle/123456789/427
Title: Functional Study of SBP5 in Copper-deficiency Response in Moss Physcomitrella patens
Other Titles: การศึกษาหน้าที่ของ SBP5 ในการตอบสนองต่อภาวะขาดธาตุทองแดงในมอส Physcomitrella patens
Authors: Metha Meetam
Keywords: copper starvation;gene expression;moss;mutant
Issue Date: 2015
Publisher: The 9th Botanical Conference of Thailand: BCT9 -Stepping toward Global Forum (การประชุมวิชาการพฤกษศาสตร์แห่งประเทศไทย ครั้งที่ 9)
Citation: Proceedings of the 9th Botanical Conference of Thailand;P4-01
Abstract: Copper is an essential plant micronutrient. In flowering plants such as Arabidopsis thaliana, the adaptation mechanism to copper deficiency involves transcriptional regulation of genes in various processes and is mediated by a copper-regulatory transcription factor SPL7. However, the adaptation mechanism in nonvascular plants is not well understood. In this study, the amino acid sequence encoded by the SBP5 gene in Physcomitrella patens was identified as an ortholog of SPL7. To examine the function of SBP5, a knockout mutant of P. patent was constructed using homologous recombination with a modified pTN186 plasmid that contained a hygromycin-resistant gene flanked by approximately 1-kb SBP5 sequences. The plasmid was introduced to moss protoplasts using a PEG-mediated transformation method. PCR analysis of genomic DNA from the moss transformant confirmed the integration of the selectable marker gene in the SBP5 locus, and semi-quantitative RT-PCR analysis of total mRNA could not detect SBP5 expression. These results indicate that the SBP5 gene was completely knocked out. Further characterization of the sbp5 mutant should lead to better understanding on the function of this gene.
Other Abstract: ทองแดงเป็นธาตุอาหารรองที่จาเป็นสา หรับพืช ในพืชดอก เช่น Arabidopsis thaliana กลไกการปรับตัวต่อภาวะขาดธาตุทองแดงเกี่ยวข้องกับการควบคุมการถอดรหัสของยีนในหลายกระบวนการและเกิดขึ้นโดยทรานสคริปชั่น แฟคเตอร์ SPL7 ที่ถูกควบคุมการทา งานด้วยธาตุทองแดง แต่กลไกการปรับตัวในพืชไม่มีท่อลาเลียงยังไม่เป็นที่เข้าใจนัก ในการศึกษานี้ลำดับอะมิโนของโปรตีนที่ได้จากยีน SBP5 ในมอส Physcomitrella patens ถูกพบว่ามีความคล้ายกับ SPL7 เพื่อ ตรวจสอบหน้าที่ของ SBP5 P. patens พันธุ์กลายที่ถูกทาลายยีน SBP5 จึง ถูกสร้างขึ้นด้วยกระบวนการโฮโมโลกัสรีคอมบิเนชันกับพลาสมิด pTN186 ที่ถูกเปลี่ยนแปลงให้มียีนต้านยา hygromycin (ApH4) ขนาบข้างด้วยลา ดับเบสของยีน SBP5 ความยาวประมาณ 1 kb พลาสมิดถูกนาเข้าสู่โพรโทพลาสต์ของมอสด้วยวิธีการถ่ายยีนแบบที่ใช้โพลีเอทิลีนไกลคอล ผลการวิเคราะห์ด้วยวิธี PCR ของดีเอ็นเอจากจีโนมของมอสที่ถูกถ่ายยีนยืนยันการแทรกตวั ของยนี ApH4 ในตาแหน่งของ SBP5 และการวิเคราะห์ด้วยวิธี semi-quantitative RT-PCR ของเอ็มอาร์เอ็นเอทั้งหมดไม่สามารถตรวจพบการแสดงออกของ SBP5 ผลการทดลองเหล่านี้บ่งชี้ว่ายีน SBP5 ถูกทาลายอย่างสมบูรณ์ การศึกษาลักษณะของมอสที่ขาดยีน SBP5 ในอนาคตน่าจะนาไปสู่ความเข้าใจที่ดีขึ้นถึงหน้าที่ของยีนนี้
URI: http://ir.sc.mahidol.ac.th/handle/123456789/427
Appears in Collections:Biology: International Proceedings

Files in This Item:
There are no files associated with this item.


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.